Поливането е една от основните задачи за управление на бонсай растенията. Поливането изглежда просто, но не е лесно да се напои както трябва. Поливането трябва да се извършва според вида на растението, сезонните промени, периода на растеж, периода на цъфтеж, периода на покой и метеорологичните условия на растението. Овладяването на времето и количеството на поливане е много важно за растежа на растенията. Смъртта на някои бонсай растения е пряко свързана с неправилно поливане.

Освен че доставя вода и хранителни вещества на саксийните растения, почвата в саксията също така поддържа нормалното дишане на въздуха от растенията. Когато почвата в саксията има достатъчно влага, частиците на почвата се разширяват, изстисквайки въздуха в пролуките между частиците, което води до липса на въздух в почвата в саксията; когато почвата в саксията е суха или относително суха, частиците на почвата се свиват, обемът става по-малък и отново се появяват празнини между частиците. Празнините се запълват с въздух.

Тъй като почвата се променя между суха и влажна, въздухът в почвата на саксията също циркулира непрекъснато, което позволява на корените на растението да дишат нормално. След всяко поливане корените на растението ще могат да понасят липсата на кислород в почвата в саксията за кратък период от време. Въпреки това, ако почвата в саксията е твърде влажна за дълго време, което води до дългосрочна липса на кислород, това ще причини ерозия на корените и други заболявания; Ако почвата е суха за дълго време, въпреки че в саксийната почва има достатъчно кислород, растенията не могат да абсорбират вода за дълго време, което също е вредно за растежа на растенията и дори може да причини смъртта им. Ето защо, когато поливате бонсай растенията, трябва да се следва принципът „не ги поливайте, когато са сухи, поливайте ги обилно“.

Недостатъчното поливане и дехидратацията на растенията ще доведе до изсъхване и увисване на клонките, изсъхване, пожълтяване и окапване на листата. При иглолистните видове иглите ще станат меки и ще загубят силното си и бодливо усещане. При сериозен недостиг на вода кората на клончетата се свива като настръхнали. Ако срещнете тази ситуация през лятото, трябва незабавно да преместите растението на засенчено място. След като температурата спадне, първо напръскайте листата с вода, след това налейте малко вода в саксията и след това изсипете водата обилно след един час.

За силно дехидратирани растения не забравяйте да поливате достатъчно наведнъж, защото когато растението е силно дехидратирано, кореновата кора се е свила и е близо до ксилемата. Ако внезапно се достави голямо количество вода, кореновата система ще се разшири поради бързото абсорбиране на вода, причинявайки разкъсване на кората, което води до смъртта на растението, така че трябва да има постепенен процес на адаптация. След като растенията, които имат сериозен недостиг на вода, преминат през горната обработка, най-добре е да ги държите под навес за сянка за няколко дни и след това да ги култивирате на слънце, след като укрепнат. Не прекалявайте с поливането обаче. Освен че кара растенията да растат стръмно, засягайки формата на дървото и декоративната стойност, прекомерното поливане също може лесно да причини гниене на корените и смърт. Миниатюрните саксии за бонсай изискват по-малко почва, така че е особено важно да ги поливате в точното време и в точното количество.